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一天检测量达上百万,二代测序还能如此开挂?

Posted on 2021-04-23 10:17:30 by , 0

    居高不下的新增病例,对美防疫提出了更加严格的要求,同时也是对检测量的一大挑战。

    GinkgoBioworks是一家成立于2008年,位于美国波士顿的生物公司。业务涉及医学检验、疫苗开发、酶开发、发酵等多个生命科学相关领域。

    在疫情发生以后该公司随即展开了高通量的新冠检测和新冠的突变研究工作。与通常我们采用定量PCR进行新冠检测不同,该公司在方法学上主要采用的是二代测序的方法。

    该公司日检测量高达百万份,时间紧任务重,二代测序流程本身就较为冗长,而其中的PCR步骤也是耗时较多的部分,如何才能在最短的时间里完成任务部署?

    在关键时刻,GinkgoBioworks立即想到了EppendorfMastercyclerX50系列PCR仪。

    10度/秒的升降温速度,远高于一般PCR仪,如此出色的性能,为繁重的检测工作减轻了许多负担。

    在进行小批量测试后,该公司果断购买了155台X50PCR仪来满足极高的通量需求,而且为了便于统一管理如此之多的PCR仪,GinkgoBioworks还引入了EppendorfCyclemanageX50软件系统,一套软件可以同时管理多达50台X50eco系列PCR仪。

    面对庞大的检测量,硬件与软件的结合,不仅省去了重复繁重的劳动,还让实验结果更加可靠。