从最早期的手工操作PCR反应，到半自动机械臂在水浴中操作PCR反应，再到目前已经非常成熟的半导体（Peltier）温控技术，PCR设备对操作人员来说已经变得越来越友好，越来越便利。
早期的PCR条件优化只能一次又一次地不停尝试各种实验条件的组合，直到90年代中期Eppendorf在5331系列PCR上实现了不同列之间不同温度的功能，一次实验就能够测试12个不同的条件，一下子将PCR实验条件优化的效率提高了10倍以上，这也是我们所熟知的PCR梯度功能。
PCR仪作为一个成熟的设备，是否还有发展的空间呢？
答案是肯定的，Eppendorf在最新的Mastercycler®X50系列PCR仪上引入了创新的2D梯度功能。
世界著名的MPICBG（MaxPlanckInstituteofMolecularCellBiologyandGenetics）的科学家，在使用了EppendorfMastercycler®X50的2D梯度功能后表示，使用2D梯度可以非常方便地在一次实验中对PCR反应过程中的两个温度步骤进行优化（如，变性与退火），一次可以摸索96个不同的温度条件组合。
这样的条件优化对于难以扩增的高GC含量的模板的条件优化显得尤为重要。
而这使得PCR条件优化的过程有了全新的可能性。
